Процесс сушки, конечно, будет замедляться, так как вода должна выходить из все более глубоких и далеких мест. Думаю, за трое суток, вся вода не уйдет. Не спеши, держи доску под пушкой. Пока ровняй дно, готовь кусок ПП для вставки, готовь мачтпогон и тп... Если возможно найти кусок более плотного ПП, то было-бы лучше вставить его, а в него уже вклеить мачтпогон.

Как собираешься закрывать палубу?

>Основная возня будет с герметизацией текущей закладной изнутри, без её выдирания.

Фигня вопрос. Просверли на 5 мм глубже, и шприцом залей немного ПУ клея. Как вспенится и чуть подсохнет затрамбуй пену вглубь отверстия, до нужной глубины.